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中国首部《中国实体瘤NTRK融合基因临床诊疗专家共识》发布

发布时间:2022-08-31 17:19 文章作者:云鸿科技 浏览次数:999
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NTRK基因融合是用于泛癌种靶向治疗重要的分子标志物,随着两款泛癌种靶向药物拉罗替尼和恩曲替尼的获批上市,以及临床数据卓越,NTRK基因已成为全球最火的抗癌靶点之一。


目前,多个癌种相关治疗指南中均推荐检测NTRK基因检测。


8月25日,我国首部《中国实体瘤NTRK融合基因临床诊疗专家共识》(以下简称“共识”)正式发布。


NTRK融合基因治疗建议、检测方法、检测时机、质量控制提出共13条共识。


共识1:所有晚期成人实体瘤和儿童实体瘤患者均建议进行NTRK融合基因检测,并且根据不同癌种的特性采取不同的检测策略。(推荐级别:强烈推荐)


共识2:晚期成人实体瘤和儿童实体瘤患者应该在标准治疗前或者治疗期间考虑进行NTRK融合基因检测;NTRK基因融合发生率高的局部晚期肿瘤患者应在新辅助治疗前进行检测。(推荐级别:强烈推荐)


共识3:使用覆盖NTRK基因内含子区域的NGS DNA panel或者全外显子组检测作为NTRK融合基因检测的首要手段,NGS RNA panel或者转录组作为NTRK融合基因检测的重要补充手段。NGS RNA panel比 DNA NGS panel具有更高的灵敏性,尤其在IHC呈阳性,DNA NGS panel检测阴性的情况下建议RNA NGS panel确认。在条件允许的情况下推荐同时提取FFPE切片的DNA和RNA,以达到并行开展DNA和RNA 测序的目的。(推荐级别:强烈推荐)


共识4:ETV6-NTRK3 FISH检测可以作为NTRK融合基因发生率高的肿瘤的确诊手段,其他类型实体瘤则不建议。检测阳性患者建议进一步通过NGS检测确认相关结构变异事件是否具有生物学功能。(推荐等级:推荐)


共识5:RT-PCR检测可以作为NTRK融合基因发生率高的肿瘤和在已知伴侣基因的情况下的确诊手段,如:ETV6-NTRK3的NTRK融合基因。其他类型实体瘤则不合适。同时建议使用NGS检测手段作为RT-PCR阴性患者的补充检测手段。(推荐等级:推荐)


共识6:pan-TRK IHC可以作为NTRK融合基因发生率较低、NTRK基因不表达且常规条件下不推荐NGS DNA panel方法的癌种初筛方法。也可以作为NGS检测手段的复核手段。(推荐等级:推荐)


共识7:按照NTRK 基因融合事件发生率、TRK蛋白生理性表达和NGS检测普及度,建议以30%普及度作为区分普及度高低的标准,分为三类肿瘤并进行NTRK融合基因检测。(推荐等级:推荐)


共识8:建议各医院病理科建立起NTRK检测的标准流程表,联盟定期发布各癌种NGS检测临床意义重要性分级建议,在肿瘤精准诊疗快速发展的过程中以NTRK融合基因检测为标志,积极促进各级医院精准诊疗的发展。(推荐等级:推荐)


共识9:各类检测应该在具有医学检验资质的实验室中进行,建议选择通过如ISO15189、CAP、CLIA等权威机构认证的实验室。实验室需要按规范开展NTRK室间质控与室内质控。(推荐等级:强烈推荐)


共识10:通过病理质控的FFPE肿瘤组织方可用于NTRK 融合基因检测。在肿瘤组织获取困难或FFPE样本中肿瘤细胞含量不足的情况下,晚期肿瘤患者可选择采集外周血进行基于ctDNA的检测;一般来说新鲜样本是RNA检测最佳材料,如可以获取且确保取材含有足够肿瘤组织/细胞的新鲜样本,也可以用于DNA+RNA检测,但因取材经验不足,可能存在取样组织中肿瘤细胞含量不足的风险;推荐活检组织在10%福尔马林中浸泡6-12小时,手术组织浸泡24-48小时。选择FFPE样本做DNA和RNA NGS检测时,尽量选择最近时间段的样本,原则不应超过两年。选取的切片中需要有一定比例的肿瘤细胞,以满足不同检测平台的检测要求。一般做IHC或者FISH时,至少需要50个肿瘤细胞;RT-PCR需要至少5%的肿瘤细胞;NGS检测建议样本的肿瘤细胞含量至少在20%以上。


如果切片中肿瘤细胞含量太少,可以考虑显微切割等方式进行肿瘤组织的富集。切取不同患者肿瘤样本时应有效清理或者更换刀片和摊片池水,避免蜡片交叉污染。


包含NTRK 融合基因的NGS DNA检测产品必须注明融合基因探针覆盖区域(包括内含子),为尽量避免假阴性,建议选择覆盖区域比较完整或者同时含有NGS RNA检测的产品。(推荐等级:强烈推荐)


共识11:检测报告除了常规基本信息与质控信息外,应该包括样本肿瘤细胞含量的比例、是否经过显微切割富集肿瘤组织及细胞、提取的DNA浓度和纯度等指标。NGS检测报告融合阳性需要包含断点染色体位置信息、酪氨酸酶结构域包含情况和是否框内转录等信息。NGS报告中符合酪氨酸激酶结构域包含和非阅读框改变才可考虑报NTRK 融合基因,不满足的情况下需要报NTRK融合基因。(推荐等级:强烈推荐)


共识12:不同检测方法之间结果不一致、新发现融合伴侣或者融合基因结构、复杂融合事件、未能清晰判断是否为框内转录、未能清晰是否包含完整酪氨酸酶结构域或者多个驱动基因阳性等其他临床医生有疑问的情况下,建议通过MTB(分子肿瘤专家委员会)讨论后决定下一步治疗方案。(推荐等级:强烈推荐)


共识13:建议NTRK融合基因的实体瘤患者临床使用拉罗替尼、恩曲替尼等TRK抑制剂或者参加相关TRK抑制剂临床试验。NTRK融合基因耐药患者推荐使用NGS检测发现耐药突变,以便于判断是否适合参加二代TRK抑制剂治疗或者临床试验。(推荐等级:强烈推荐)


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